A estrutura de governança da Confebras é simples e funcional, baseada em um modelo consagrado pela agilidade e assertividade das decisões: Conselho de Administração, Conselho Fiscal e Diretoria Executiva. O primeiro colegiado é composto por sete membros e o segundo por cinco, entre titulares e suplentes, com mandato de dois anos. A Diretoria Executiva é composta por três membros, nos cargos de Presidente, Vice-Presidente e Diretor.

Com esta certeza, e pautada pela ética, pela transparência, pela cidadania e pela responsabilidade socioambiental, assim se estrutura a governança da Confebras:

• DiretoriaPresidente – Kedson Pereira Macedo (Sicoob Planalto Central)
  Vice-Presidente – Celso Ramos Régis (Sicredi União MT/TO)
  Diretor – Moacir Krambeck (CECRED/SC)
• Conselho de Administração Presidente – Kedson Pereira Macedo (Sicoob Planalto Central)
  Vice-Presidente – Celso Ramos Régis (Sicredi União MT/TO)
  Diretor – Moacir Krambeck (CECRED/SC)
  Conselheiro – Marcelo Martins (Sicoob Central SP)
  Conselheira – Maria Antônia de Oliveira Bueno (Sicoob Central Cecresp)
  Conselheiro – Rui Schneider da Silva (Sicoob Central SC/RS)
  Conselheiro – Vitor Hugo Gomes (Sicoob Central Crediminas)
• Conselho Fiscal João Carlos Gonçalves Bibbo (Sicoob CECRES)
  Pedro Caldas (Sicredi Planalto Central)
  Rodrigo Matheus S. de Moraes (CNAC)
• Suplentes Alberto Rikito Tomaoca (Sicredi União MT/TO)
  Gustavo Lange (CECRERS)